Uma das atividades mais comuns utilizando o git é o comando merge utilizado para mesclar branchs, como por exemplo quando ocorrem atualizações no branch de desenvolvimento pelos seus colegas, exatamente enquanto você trabalhava em uma funcionalidade, no momento seu branch está desatualizado, e antes de efetuar uma pull request para enviar suas alterações ao branch de desenvolvimento, é necessário efetuar uma junção dessas modificações.

Primeiramente selecione o branch que foi atualizado no GitHub por seus colegas, o qual ainda não possui as alterações na sua máquina localmente.

git checkout branchcolegas

Agora é necessário efetuar um pull para receber as atualizações no branch selecionado.

git pull origin branchcolegas

Então para que não ocorra problemas efetuando uma pull request diretamente para o branch de desenvolvimento, ao fazer um push é recomendável criar um novo branch.

git checkout -b branchdetransicao  

Ou você pode utilizar o mesmo branch que estava trabalhando, no caso basta ir até ele.

git checkout meubranch

Se você escolheu a opção de criar um branch, é necessário efetuar o comando merge nele.

git merge meubranch  

Ou se não criou um branch novo, você precisa trazer os arquivos do branch de seus colegas para o seu usando.

git merge branchcolegas

Em alguns casos é aberto uma tela para efetuar os comentários dessa pull request, comente ou use ESC + : + Q, após isso podem ocorrer problemas na mesclagem por conta de seus colegas tiverem trabalhado nos mesmos arquivos que você, para corrigir verifique no terminal o nome dos arquivos com conflitos e abra seu editor ou IDE neles, todos os conflitos são comentados dentro do arquivo informando a sua alteração e a de seus colegas, para corrigir basta descomentar deixando somente o código correto, e após todas as correções serem efetuadas é necessário efetuar um commit.

git add .
git commit -m "Exemplo efetuado merge no branch"  

Agora então é só efetuar uma pull request para o branch de desenvolvimento normalmente, efetuando um push ou pull request pelo GitHub.

git push origin branchdedesenvolvimento  

É recomendável efetuar pull request para branchs principais usando o site, onde assim que abertas repassar aos colegas com a finalidade de revisão, sendo mais seguro de não ocorrer nenhum problema nas alterações enviadas.